机动绝记高达SEQUEL在设定上与传统高达系列及其他同类机甲漫画有显著不同。首先，它引入了‘记忆共鸣’系统，让驾驶员与高达通过精神链接更深层次互动，而非仅依赖机械操控。这种设定强调角色情感与机体的共生关系，突破了传统高达以战争政治为核心的模式。

其次，SEQUEL的世界观更注重近未来科技与神秘元素的融合。不同于多数同类漫画强调真实系或超级系流派，它混合了科幻与奇幻，例如高达的推进系统部分源于被遗忘的古代遗产。这种设定让剧情更具探索性，而不仅仅聚焦于冲突。

在剧情深度上，SEQUEL超越了传统的善恶二元对立。它通过多视角叙事展现各方动机，模糊了英雄与反派边界。与同类作品如《全金属狂潮》或《魔神Z》相比，SEQUEL更强调角色的内心挣扎和哲学思考，而非单纯展示机甲战斗。

另外，SEQUEL的视觉风格也独树一帜。它借鉴了赛博朋克元素，结合高达的机械美学，创造出一种破旧却充满科技感的艺术基调。这与主流高达动漫的干净设计形成对比，专注于更真实地描绘战后世界的疮痍和人物在其中的生存状态。